■きのこ軍
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アイム
本作の主人公。記憶が戻り自分の正体が分かった。過去の経験と会議所での修行を経て、一匹狼から会議所兵士を導く象徴となる。
嫌いなものはDB。信頼しているものは仲間。
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参謀
『きのこ三古参』の一人。wiki図書館の館長。集計班の後を継ぎ会議所全体をまとめあげている。DB討伐隊隊長としてスクリプト殲滅に成功。
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¢(セント)
『きのこ三古参』の一人。発明家。なぜかただ一人DBに寄り添い続ける。誰よりも強いが誰よりも繊細で打たれ弱い。
■たけのこ軍
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オニロ
本作の主人公。記憶が戻り自分の正体が分かった。持ち前の性格に加え自らの役割を理解し、会議所兵士を導く象徴となる。
守りたいものは大戦世界そのもの。
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791(ナクイ)
たけのこ軍中堅。大魔法使い。魔法使いの腕前として肩を並べる者はいないが、強力魔法が多いゆえにMPが枯渇しがち。枯渇すると疲れて寝てしまう。
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筍魂
たけのこ軍中堅。戦闘術魂の伝承者。戦闘能力だけでは791と双璧を張るが、ご多分に漏れずスタミナがめちゃくちゃない。
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抹茶
たけのこ軍古参。黒砂糖に裏切られDBにも洗脳されたりと踏んだり蹴ったり。でも本当はスゴイやつ。
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山本
たけのこ軍古参。会議所の新人教育担当。昔は鬼教官として有名だったが乙牌教の教祖と判明してから評価は地に落ちた。洗脳されやすそうな体質をしている。
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社長
たけのこ軍古参。占い師だが集計班が消えて以降は占えていない。
「きれぼし語」を用いるため誰ともコミュニケーションは取れないが、過去の大戦まではまともに会話できていた。
■その他
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軍神<アーミーゴッド>
かつて大戦世界に存在した現人神。DBと対極の存在。
人々に士気を与える象徴として君臨していたが、人々が大戦を忘れるとともに軍神も世界から姿を消してしまった。
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スリッパ
元たけのこ軍兵士。かつては最年少の大戦の英雄として将来を渇望されていたが、突如大戦を引退。
なぜか時限の境界の過去跳躍に並々ならぬ執着を見せる。
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サラ
スリッパのメイドロボ。ロボットといっても、一見すると普通の姿である。
スリッパへの命令以外にはほとんど動かない。喋らない。何らかの魔法をかけられていることを無口に看破された。
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コンバット竹内
二代目・DB討伐隊隊長。現・ただの爺。
何らかの理由により集計班に呼ばれた“イレギュラー”な存在。
■過去の兵士たち
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集計班
『きのこ三古参』の一人。Chapter2最後に何者かに消されてしまう。
秘密裏に竹内を招集したり、過去世界でもアイムの存在を知っていたりと秘密を知っている存在だったが、動きすぎたがゆえに消されてしまった。
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無口
初代wiki図書館館長。K.N.C47年のwiki図書館大火災の首謀者。
超高度魔法『メルティカース』で大戦年表編纂室を創り上げるため、原因不明の大火災を演出した。
未来を知っているかのような思わせぶりな態度で、アイムたちの目の前で消えてしまう。
■敵勢力
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DB(ダイヴォー)
きのこたけのこ大戦世界における“邪悪”を体現する存在。時限の境界を使い、世界の兵士の「希望」を食い物にしている。
数多の兵士を洗脳し会議所を追い詰める。兵士の“負のオーラ”がないと生きていけない。天敵は軍神<アーミーゴッド>
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神父・黒飴
きのこ軍兵士 黒砂糖がDBの洗脳を受けた後の姿。DBの周到な計画で物語開始前に既に潜在的な洗脳を受けていた。
具現化する絵師としてDBの暗躍を大いに支える。きのこ軍兵士時代は紛争で96撃破をした“鉄人”として恐れられていた。
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スクリプト
大戦の遂行を邪魔しようとする自動機械(オートマシン)。
小蝿と喩えられるほどにケタタマシイ快音波を発し、兵士の士気を削ぐ行動をする。会議所内部の檻からDBともに脱走した。
Chapter3.の時点でスクリプト製造工場を全て破壊されそのほとんどが討伐された。