幼い頃から神童として神懸かり的な直感力、そして周囲の人をひきよせるカリスマを備えていた。
ある年のこと、中央政府からの長期予報で暖冬と言われた村民は、ルイカの実(暖冬用)を育てようとするが、麻耶がそれを制してミズチの実(極寒用)に変えるように説得する。するとその年は吹雪が相次ぎ、ルイカの実は半分しか育たなかった。
この時点で麻耶の巫女としての力は中央政府にいた物見巫女(天気や新元号を占う巫女)達を凌いでいた事が解る。
クレアムーンは、古くから神託によって国主を決める習わしがあり、彼女も1246年には聖都クレア(
ヒモロギの美称)へ渡り、中央で
巫女位となり、1252年には前
神威巫女吹雪の病没に伴って新たな神託を受け「神威巫女」として国の最高位となる。
しかし、
クレアムーンの政治、軍事、外交のあらゆる決定権は20名からなる神官が握り、神官達は自分たちの決定した内容を一切拒否しない「傀儡」としての巫女を欲し、そのカリスマだけを利用して「巫女が信託を受けた」として公表させたかったのである。
麻耶はそれらの風習に異を唱え、また本人の性格もあって、自ら神官の会議にも出席し、次々と神官達の矛盾を突いては反論し、更には神官の地位に隠れて私腹を肥やしていた
六道、
御影を追放した。
そして、侵略を続ける
ラグライナ帝国軍を撃退し、反撃に転じて
バライにまで進軍するが、
ウルグレイの戦いで軍師
エルが操る軍勢によって敗北。
この敗北が、麻耶と神官の不仲を決定付けることとなる。
それ以後、本格的に
クレアムーンの地へと攻め込んできた
ラグライナ帝国軍に対し、
ウルグレイの戦いの様に自らが戦陣に立つことこそなかったが、進んで軍議に参加して、信頼のおける人材で編成された主力部隊を派遣。
彼女の基本戦略は、元々兵力で劣っていた
クレアムーン軍に正面決戦で勝利する力はないことから、各地を防衛しつつ大敗しないうちに戦線を後退させ、帝国軍が
ラスティに上陸したところで退路を断ち、そこで強襲を仕掛ける焦土作戦であった。
その為、
ウネピの戦い、
シチルの戦いは、想定範囲内での撤退だったが、既に神官たちとの間に信頼関係をなくしていたことから、この基本戦略を麻耶は信頼のおける仲間たちにしか告げていなかった。
神官たちは、後退を続ける戦況に焦りはじめ、神官
迦羅須は事あるごとに麻耶に責任を追及する。
こうして、内憂外患の戦いを続けるが、1254年に突然発生した「
聖都の変」によって歴史からその名前を消してしまう。
暗殺説、処刑説、自殺説、廃人説……彼女の神隠しは、この時代最大の謎の一つとされている。