・サイコガンダム（ＭＦ（モビルフォートレス）形態）
無印２弾スペシャルオペレーション「哀しみの超兵器」で登場するサイコガンダム。
最初はＭＦ形態で登場し、ＨＰを０にするとＭＳ形態に変形して、仕切りなおしとなる。
専用の必殺技も用意されていた。
サイコガンダムのＭＦ形態は変形のアビリティを発動した時にも見れる。

・ジャスティスガンダム（Ｂ）・アッガイ（Ｂ）
ガンダムインフォカラーリングコンテスト優秀賞受賞機体。（Ｂ）機体が関わる開発ミッションで登場。

・デビルガンダム（第２形態）
Ｂ６弾で登場する大型ＭＳ。
デビルガンダムは巨大ボスなので事実上プレイアブル化不可能
（機体解説は当該ページ参照、別の形である最終形態は鉄華繚乱４弾で参戦）、
筐体版では（３Ｄフィールドを使用するため様々な問題がある）無双発動が不可能になるという制約もあり
ＢＧ１弾以降出会うことが出来ない。

・セリック・アビス
・デレク・ジャックロウ
・ジョナサン・ギスターブ
・シャナルア・マレン
・オブライト・ローレイン（キオ編バージョン）
５弾トライエイジミッションで敵として参戦。「ガンダムＡＧＥ」キオ編におけるアビス隊がそろって参戦。
後の、鉄華繚乱４弾追加のストーリーモード・ガンダムＡＧＥ「戦慄！砂漠の亡霊」にて全員集結で再登場している。
ただし、搭乗機のクランシェカスタム、クランシェ、ジェノアスＯＣは未参戦のため、他の機体に乗って登場している（クランシェのみ他のカードに写ってはいるが・・・）。

・フラスト・スコール
５弾トライエイジミッションで敵として参戦。ギルボアと同じガランシェール隊の一人。
なお、彼はブルッジクルーでありＭＳパイロットではない。

・アセム・アスノ（キオ編バージョン）
コロニーショップ先行ミッションで敵として参戦。キャプテン・アッシュの顔グラフィックのまま名称とセリフがアセムに（ミッションによってはアッシュに変更）。
ゼハートもバージョン違い（キオ編バージョン）が存在する（５弾トライエイジミッションより）が存在し、こちらはセリフがキオ編の時のものに。
「ＳＰ」攻略本ではチーム名欄で区別されているが当然カードはない。

・ドラマティックＵ．Ｃ．ミッションの先行登場パイロット達（追記予定）
デニム、ジーン等、多くの名ありパイロットたちが登場。各ミッション欄を参照のこと。
レズン等、後に特集弾で参戦したパターンもあり。

・アンディ・ストロース
Ｚ２弾ドラマティックＵ．Ｃ．ミッションで登場。
６弾ハイゴッグの専用機パイロットとして記載されていたが、Ｂ５弾Ｍハイゴッグ以降では削除されている（「ＳＰ」には記載）。

・烈風ガンマ
特別ミッション・「脅威のザクエンペラー」で敵として参戦。
このゲームでの表記は「ガンマ」となっている。
ガンダムビルドファイターズの外伝「プラモダイバーキット＆ビルト」から登場し、特定のＭＳカードを使用すれば彼が使用する機体の設計図が手に入り
こちらも使用可能になった。（ＳＰはその手順で入手可能）
なお「ＳＰ」ではザクペラーの専用機パイロットとして登録されているがもちろんカードはない。

・天神キット
特別ミッション・「ビルトワイバーンの飛翔」で敵として、ライバルのガンマに遅れて参戦。
このゲームでの表記は「テンジン・キット」となっている。
本編でいうところのレイジに相当するキャラ。
ガンダムビルドファイターズの外伝「プラモダイバーキット＆ビルト」から登場しており、彼を倒すと相棒の作品が使えるようになる。
なお「ＳＰ」ではワイバーンの専用機パイロットとして登録されているがもちろんカードはない。

・ユウキ・タツヤ（ＢＦＡバージョン）
特別ミッション・「アメイジングバトル」で登場。
中学生時代のタツヤ。この頃はガンプラ塾で（地獄の）教育を受けていた。

・ワタリー・ギラ
Ｂ８弾期の特別ミッション・「宇宙戦国時代」にのみ登場するレアキャラ（後にストーリーモードに採用され、いつでも戦えるようになった）。
良識あるザンスカール軍の士官で騎士道精神を奉している。
鬼気迫るプレッシャーと螺旋拳（回転パンチ）でウッソのヴィクトリーをあと一歩まで追い詰めるも、咄嗟の判断で乗機を撃破され、子供（ウッソ）が戦争をするという辛い現実を噛み締めた後に手榴弾で自決した。

・ＢＧ３弾登場「ビルドファイターズトライ」パイロット達
精練高専、宮里学院高校の各パイロットがＣＰＵ限定で登場。
ＴＡＫＵのみはＴＫ弾にも登場（下記）。ＢＧ３弾のミッション参照。

・ＴＡＫＵ
ＢＧ３弾のミッション及び再録の鉄血の１弾のストーリーモードで登場。
本編では黒い∀ガンダムに搭乗し、対戦中にカミキ・ミライに下心を持った邪な思いで近付くも、
彼女の操るプチッガイに股間を潰される。
会場にいた男達はその行為に恐怖した。
典型的なチャライ兄さんと思われる外見のキャラクターである。
なお後の公式「ホビーホビー」ではビルダーとしても更生した模様で、
恩師の機体をモデルにしたガンプラ・ターンエーガンダムシンを掲載している。

・マツナガ・ケンショウ
ＢＧ５弾の総選挙ミッションで登場。後に、鉄華繚乱３弾追加のストーリーモード・ビルドファイターズトライミッション「ビヨンド・ザ・ナックル」にて再登場。
鹿児島県代表・我梅学園：チーム・ホワイトウルフのリーダー。他のチームメイト２名が傲慢で心ない俗物に対して、彼自身はバトルになると気性が荒くなるが、温和で正々堂々とした人物である。
本編では強敵に対する咬ませ犬の様な扱いが目立っていたが本ゲームでも残念ながら咬ませであった・・・。
専用機は使用ガンプラの原型である高機動型ザクＩＩ（シン・マツナガ専用機）。

・刹那・Ｆ・セイエイ（リペアバージョン）
ＢＧ６弾のシークレットミッションで登場。
刹っちゃん、刹っさん、刹沙慈とも異なる第４のバージョン。通称「黒刹っさん」。
国連軍との決戦を経て、メンバーとも離散し、４年間秘密裏に且つ孤独な戦いを続けていった姿。
使い慣れたガンダムも直し直し使い続けて行った結果、ボロボロになったエクシアを愛機として戦い続けていた。
しかしコロニー・プラウドの戦いで新型機・アヘッドとの性能差で絶体絶命に陥るもティエリアに救われ、ＣＢに復帰した。

・コーラル・コンラッド
鉄１弾の鉄血ミッション「イサリビ出航」にのみ登場するギャラルホルン火星支部の支局長。
秘密裏にノブリス・ゴルドン（クーデリアのパトロン）と結託し資金提供を受けよう（ただしその内容が私腹を肥やすことなので明らかに不正行為ではあるが）とクーデリア・藍那・バーンスタインを抹殺すべく
ＣＧＳへの襲撃を決定した人物でクランク、アインの直属の上司に当たる人物。
作中でギャラルホルンが度々鉄華団の道中を邪魔をする原因を作った人物であり、（ある意味）全ての元凶といえる。
最終的に監査部を出し抜いて火星軌道上の鉄華団を襲撃するものの
グレイズのパーツで強化されたバルバトスのメイス付帯パイルバンカーで圧殺された。
初陣のアインを激励する為にＭＳハンガーまで来たり、三日月を今一歩まで追い詰める技量を持っていたりと元はＭＳパイロットではないかとの説もある。

・ガリー・タン
ザンスカールのＭＳパイロット。チャレンジミッション「量産機チームの挑戦！」で参戦し、後にストーリーモードの方にも登場。
味方のクロノクルが乗っていたと誤解していたとはいえウッソのシャッコーに初めて撃墜されてしまった人。
その後、戦死した戦友であるサバト（下記）の仇を取るため軍医の制止を振り切って完成したばかりの新型機ゴッゾーラ（参戦した場合、登場した話のサブタイトルにあやかって「ゴッゾーラの反撃」持ちで登場されることが予想される）で強行出撃した。
単身、リガ・ミリティアのアジトを襲撃したがウッソのヴィクトリーと相打ちとなり乗機を撃破されるものの銃を手に取り単身で挑むが、最終的にリガ・ミリティアの捕虜となり喚き散らしながら退場した。

・ドレル・ロナ
鉄華繚乱弾のストーリーミッションで登場。
カロッゾの連れ子で、ベラの異母兄にあたる。
ドレル大隊の指揮官としてコスモ・バビロニア戦争を戦い抜く。
搭乗機が決戦！ベルガ・ギロスのクエスト解放条件対象であるため出会っている人も多いだろう。
ちなみに本ゲームの搭乗機はベルガ・ギロスになっているが、原作ではベルガ・ダラスである。

・ライオール・サバト
ザンスカールのＭＳパイロット。ドラマチッククエスト「決戦！ターンＸ（子安祭り）」で参戦。
ラゲーン基地所属でガリー・タンとは戦友の間柄。
これでゾロ（一般機）は専用パイロットを３人迎えている。
作中ではウーイッグ（プラハ）空襲に従事しており、ゾロ（ＭＡ形態）のガトリングガンで一般市民を楽しみながら虐殺している外道で
カルルマン・ドゥカートゥス（赤ん坊）の母親も犠牲になっている。
その後の戦いでウッソのシャッコーにコックピットを貫かれており、ウッソに最初に殺された（※単なる撃墜ならガリーのゾロが最初）人物となった。
ちなみに彼の死を聞き、ガリーは敵討ちに新型機を強奪同然で出撃したが、結果は上記の通り。

・ユニコーンガンダム（ユニコーンモード）
Ｂ７弾アトラクトムービーの各話再現シーン及びＳＰのＰＶ２（カタパルトからの射出時）及びＳＰのオープニングで登場。
ＦＡユニコーン（Ｕ）のモデルから武装を抜いた姿だと思われ、最後のユニコーンバリエーションと思われる機体。

・メイジン・カワグチ（エンボディシステムバージョン）
Ｂ６弾ＣＭでレイジと戦闘。
顔グラフィックのみでゲーム画面には出てはいない（設定画がない？）が、本来はこちらがガンダムエクシアダークマターのパイロット。
ドラマチッククエストモード（ＴＫＲ４弾）でもミッションイントロで登場。
ＯＡ５弾Ｒのカードイラストはエンボディシステム版であるが、ゲーム上では通常版として扱われる。