（2010年11月23日追記）
うーむ、Windowsばっかりの生活から戻ってきたら、LinuxMint Debian Editionなんてのが出てたので、入れてみました。fdiファイルでは動かなかったので、調べてみたらGUIで設定できるんですね。それで動きました・・・・。gnomeでは、以下の方法を試してみるのもいいかもしれません。もうちょっと調べてみないとなあ・・・。

$ sudo sudo aptitude install gpointing-device-settings

参考：
thinkwiki - How to configure the TrackPoint
http://www.thinkwiki.org/wiki/How_to_configure_the...
debianwiki - installingDebianOn/Thinkpad/Trackpoint
http://wiki.debian.org/InstallingDebianOn/Thinkpad...

（2009年07月16日追記）
久しぶりにLinux（Ubuntu9.04）をThinkPad T60で使うことにしたら色々変わっててビックリ・・・。Ubuntu8.10からxorg.confに手を加えてはいけないそうです。で、mouse-wheel.fdiを新規に作成して再起動したらいいそうです。

$ sudo gedit /etc/hal/fdi/policy/mouse-wheel.fdi

<match key="info.product" string="TPPS/2 IBM TrackPoint">
 <merge key="input.x11_options.EmulateWheel" type="string">true</merge>
 <merge key="input.x11_options.EmulateWheelButton" type="string">2</merge>
 <merge key="input.x11_options.XAxisMapping" type="string">6 7</merge>
 <merge key="input.x11_options.YAxisMapping" type="string">4 5</merge>
 <merge key="input.x11_options.Emulate3Buttons" type="string">true</merge>
 <merge key="input.x11_options.EmulateWheelTimeout" type="string">200</merge>
</match>

Ubuntu日本語フォーラム - xorg.confにInputDeviceのSectionがありません
https://forums.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?pid=20...

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（以下は、以前の記事です）
ThinkPad R32のトラックポイントを使えるようにします。トラックポイントは元から使えるけど、トラックポイントと真ん中ボタン（正式名称知らない(^_^;)の組合せでスクロールできるようにします。大変便利。

で、またコピペ(^_^;)
こちらのページを参考にさせていただきました。
http://www.nurs.or.jp/~sugi/tp-track.htm

上記のページを見てもらえば以下は読む必要がない…けど、一応X.orgなので若干違うから(^_^;)

$ sudo vi /etc/X11/xorg.conf

viの操作がわからなければ、

sudo gedit /etc/X11/xorg.conf

でダイジョブ。
以下のような部分を探して、

Section "InputDevice"
　　Identifier　　"Configured Mouse"
　　Driver　　　"mouse"
　　Option　　　"CorePointer"
　　Option　　　"Device"　　　　　　　　"/dev/input/mice"
　　Option　　　"Protocol"　　　　　　　"ImPS/2"
　　Option　　　"Emulate3Buttons"　　　"true"
　　Option　　　"ZAxisMapping"　　　　　"4 5"
EndSection

このSection "InputDevice"とEndSectionの間に以下を記入します。

　　Option　　"EmulateWheel"　　　　　　　"true"
　　Option　　"EmulateWheelButton"　　　　"2"
　　Option　　"EmulateInertia"　　　　　　　"50"

これでXを再起動すれば、有効になります。