MORROWINDへの道標

あるゲームにおいてModを無効にしたい、ということでしたら、起動直後のメニューにある「Data Files」でそのModのチェックを外すだけです。ただしプレイ途中のゲーム（セーブデータ）において問題が発生する場合があります。

導入したModのファイル自体も削除したいということでしたら、該当ファイルを手動で削除する方法しか私は知りません。そのファイルが他のModで使用されている可能性もありますので注意してください。