Windows Buildをクリックします。
このような画面が出るので、64-bit Staticになっていることを確認してから
下の青い[Download FFmpeg]のボタンをクリックします。
Versionは日付でない方を選べばよいでしょう。
これでZipファイルをダウンロードできました。
ダウンロードしたZipファイルを展開します。
展開されたフォルダを開いていくとbinというフォルダがあり、その中にffmpeg.exeが入っています。
AnimeEffects.exeの隣のtoolsフォルダの中に
先ほどのffmpeg.exeをコピペします。
これでAnimeEffectsから動画ファイルを出力できるようになりました。