概要 
Ver.6.5.0にて実装されたストーリー。
Ver.7.2.0より第2章、Ver.8.3.0より第3章が実装。
ver.11.3より宇宙編第1章にゾンビ襲来ステージが実装。
舞台は宇宙。
未来編で登場したエイリアンに加え、星の印を持つスターエイリアンが新登場する。
属性がエイリアンなのは変わらないが、ワープやバリアといった専用の特性を持つ。
未来編と違い採点報酬ステージはなく、出撃コストはレジェンドストーリーと同じ日本編第2章基準。
多くのステージに出撃制限が設けられている。
また、日本編や未来編と同じく今回もお宝集め要素がある。
スターエイリアン対策の他に、獲得経験値アップや統率力アップなど、にゃんこ大戦争をプレイするにあたって欠かせない便利な効果が揃っているので、今後のレジェンドステージや各降臨ステージをより有利に進めていきたいなら、宇宙編の攻略を早目に済ませておくことをおすすめする。
第1章クリア後、特典として神さまのサービスを以降7割引で利用できるようになる。
第2章クリアで、激・神さまが入手出来る。
第3章クリアで、プラチナチケットが入手出来、にゃんこガチャが新たににゃんこガチャ+にグレードアップされる。
そして、各章クリア時ににゃんこミッションからネコカンが受け取れる。 その後、EXステージとしてスターフィリバスターが出現するようになる。
なお、ステージ名はとびだす！にゃんこ大戦争の第三章とほぼ同じ*1（ステージ構成やステージ背景等は異なる）。
Ver.7.2.0より第2章、Ver.8.3.0より第3章が実装。
ver.11.3より宇宙編第1章にゾンビ襲来ステージが実装。
舞台は宇宙。
未来編で登場したエイリアンに加え、星の印を持つスターエイリアンが新登場する。
属性がエイリアンなのは変わらないが、ワープやバリアといった専用の特性を持つ。
未来編と違い採点報酬ステージはなく、出撃コストはレジェンドストーリーと同じ日本編第2章基準。
多くのステージに出撃制限が設けられている。
また、日本編や未来編と同じく今回もお宝集め要素がある。
スターエイリアン対策の他に、獲得経験値アップや統率力アップなど、にゃんこ大戦争をプレイするにあたって欠かせない便利な効果が揃っているので、今後のレジェンドステージや各降臨ステージをより有利に進めていきたいなら、宇宙編の攻略を早目に済ませておくことをおすすめする。
第1章クリア後、特典として神さまのサービスを以降7割引で利用できるようになる。
第2章クリアで、激・神さまが入手出来る。
第3章クリアで、プラチナチケットが入手出来、にゃんこガチャが新たににゃんこガチャ+にグレードアップされる。
そして、各章クリア時ににゃんこミッションからネコカンが受け取れる。 その後、EXステージとしてスターフィリバスターが出現するようになる。
なお、ステージ名はとびだす！にゃんこ大戦争の第三章とほぼ同じ*1（ステージ構成やステージ背景等は異なる）。
ステージ
1章
2章
3章
攻略
情報がかなり不足しています。
攻略途中、難しいステージにあたった場合はこのページのコメント欄に書けば、有志が攻略等を答えてくれるかもしれません。
道中は基本的にスターエイリアンおよびエイリアンが多いので、対エイリアン効果を持つキャラを中心に編成を組んでいけばよい。
しかし、それなりに難易度が高く、出撃制限がステージごとに異なるため、一度クリアしたら、そのままお宝が入手できるまで周回してしまうのを推奨。
未来編と同じようなステータス補正がスターエイリアンにかかっているほか、最終ステージ「ビッグバン」に登場するボスもお宝で弱体化するので、
逐次お宝を収集していくメリットは大きい。
これまでの日本編・未来編と同様にトレジャーフェスティバルも開催されているので、積極的に活用しよう。
ただし、イベント時の1日フェスは3日に1日と他のものよりも少なめ。トレジャーレーダーの使用も考えていい。
1章ビッグバンの攻略はこちら
→神さま(敵)
2章ビッグバンの攻略はこちら
→神さま（本気）
3章ビッグバンの攻略はこちら
→ファイナルギガグランド神さま
攻略途中、難しいステージにあたった場合はこのページのコメント欄に書けば、有志が攻略等を答えてくれるかもしれません。
道中は基本的にスターエイリアンおよびエイリアンが多いので、対エイリアン効果を持つキャラを中心に編成を組んでいけばよい。
しかし、それなりに難易度が高く、出撃制限がステージごとに異なるため、一度クリアしたら、そのままお宝が入手できるまで周回してしまうのを推奨。
未来編と同じようなステータス補正がスターエイリアンにかかっているほか、最終ステージ「ビッグバン」に登場するボスもお宝で弱体化するので、
逐次お宝を収集していくメリットは大きい。
これまでの日本編・未来編と同様にトレジャーフェスティバルも開催されているので、積極的に活用しよう。
ただし、イベント時の1日フェスは3日に1日と他のものよりも少なめ。トレジャーレーダーの使用も考えていい。
1章ビッグバンの攻略はこちら
→神さま(敵)
2章ビッグバンの攻略はこちら
→神さま（本気）
3章ビッグバンの攻略はこちら
→ファイナルギガグランド神さま
第1章
このページへのコメント
チョイバロトンからチョイバトロンに変わってる理由はトランスフォーマーのサイバトロン星を真似ようとしてミスったんじゃない？
デススタン3章をノックバック攻めでクリア
当方ピクシーズエアフワのみチャッソあり
なんとかノーアイテムで勝てたので参考になる部分があれば
ワープするが打たれ強い壁役のゴルファー30 ネコマシン第三35。ワープ無効壁役のデスハーデス第二31エアフワンテ33。ノックバック役のハヤブサ第二20タマウル30超神さま30。火力役のムート30チャッソ第二41 テコルガ第三39
最初は最速でチャッソのみ出し続けてそれを阻害しないタイミングで程よく財布レベルあげ。どうあがいてもスターペンに全滅させられて城に到着されるので着いたらテコルガなどの足遅いキャラでとどめを挿す 倒した瞬間超神さま生産。遅いので敵城到着までにまた金が貯まるので神さまの城感知射程850攻撃の3段目が城に当たってしまう前に他キャラで城殴れるように各キャラを生産していく(神さまの攻撃温存の為)城叩いた瞬間キャノン砲レベル1(通常砲や鉄壁砲でもいいかも)
あとは金溜まったらムートや他に援軍投下
意識したレベルはハヤブサ20以下だとモグラでワープしない。テコルガは39以上でスターペンを確定ノックバックさせる。
※最後の対スターエイリアンお宝以外コンプ
初めて4カ月くらいの新参者です。宇宙編3章が難しすぎる。だから紙様使って毎回ごり押してます。（2章は行けたけど3章は無理w」
神様頼みじゃ正直イベステージとかプレイのうまさに影響するよ
プレイスキル？なにそれ美味しいの？
君にゃんこ向いてないよ
wikiにも向いてない
え？ここまでハマったゲームドラクエとにゃんこくらいなんだー！
アグハムムがクリアできません！
そうか、難しいからガンバレ
全文検索でアグハムム引いてみな。ヒントは落ちてる。
チョイバトロン星では10たいの出撃制限あるからめっっっっっっっっっっちゃめんどい（いつもにゃんこ軍団やってることでもある）
クリアするには攻撃頻度が高いはんいアタッカーで叩く、波動持ちで一掃するなどです。これからやるかた参考になれば嬉しいです！