一科・二科制度は、教師不足と政府主導の無理な計画が原因で出来上がった制度である。
まず初めに、
一高に導入された。
当時、
一高の生徒数は1学年100名だったが、
魔法師育成の必要性の高まりから、政府主導で年次途中から1学年200名に引き上げることとなった。
しかし、
魔法師自体が貴重な存在であり、
実技を教えられる教師の数が圧倒的に不足していた。
そこで途中編入の
二科生は1年次は
理論を集中的に学び、2年次から
実技を学ぶという、
1年次の間だけ二科制度を敷く方式が考案され、年次途中で追加募集がかけられて新たに100名が
二科生として入学した。
ところが、
制服?を追加発注した際にミスが起こり、追加入学した
二科生の
制服?のエンブレムの刺繍が抜けてしまった。
これがきっかけで、
二科生はエンブレムの無い「補欠（
ウィード）」として一科生から見られるようになった。
その後、結局新年度になっても教師が確保できず、ただの誤解だった「補欠扱い」が追認され、
二科生は2年次になっても教員の
実技指導を受けられない、現在の一科・二科制度に至っている。
この追認を取り繕うため、
二科生の
制服?には刺繍がされないままになっている。
つまり、一科と二科の区別は実質的に
実技指導における指導教官の有無だけであり、
実技の授業の都合上、
実技テストの成績で分けているに過ぎない。
それ以外には制度上の区別はほとんど無く、施設の利用や
クラブ活動の予算などは一科・二科の区別とは無関係に、公平に割り当てられている。
唯一区別が存在していた
生徒会役員の選任資格に関する制限も、2095年9月の
生徒総会?で
真由美が撤廃を提案し、これが可決されたため、それ以降は
実技指導に関するものを除き、制度上の区別は完全になくなった。
