TRCUnity

UnityのPlayerSettingsで設定した自動回転の設定よりもユーザーが端末にて設定した設定を優先する為には
AndroidManifest.xml
を編集する。

<activity android:name="com.unity3d.player.UnityPlayerNativeActivity"
    android:screenOrientation="userLandscape">
</activity>

↑
うそ。Unityのバグがあるらしい。
ネイティブコードを書くしかないね☆
書いた、UserSystemSettings