特急列車・快速列車・各駅停車の3種類の列車が運転されており、
全体的には各駅停車列車が多い。
・広域輸送
全線を運行する列車は車両の都合で限られ、各駅停車は神崎〜柚子原の列車が多い。快速列車は朝夕ラッシュ時に運転される通勤快速を除き全線を運行し、
東静高速鉄道西伊豆線へ直通運転している。特急列車は全列車が東静高速鉄道西伊豆線へ直通運転している。
・南伊豆〜神崎
東静高速鉄道の管理駅である南伊豆駅の都合上で車両制限(普通車両は原則4扉車,特急車両は2扉)があり、一部の車両(普通車両だとN1000形,5000形,5300形 特急車両は東静高速鉄道7500形)以外の運行は原則としてない。そのため、各駅停車の運行本数が少なく、多少の不便が生じる。この区間を運行する各駅停車は4両編成のみで運転されるため、平日の朝夕ラッシュ時には混雑するのが当然の状況となっている。このため、宮原駅から綾戸駅以南まで行く乗客は宮原駅から快速列車に乗車して近くの主要駅で各駅停車に乗り換える方法を行っている。
・神崎〜柚子原
この区間を運行する列車は基本的に多く、朝夕ラッシュ時には4両編成を2編成繋いだ8両編成の列車をはじめとして3+3の6両編成の各駅停車も多く運転されている。尚、朝夕ラッシュ時には特急車両を用いた通勤快速列車も運転されており、発車時刻間際になると利用する乗客で快速停車駅は混雑する。