FrontPage-Cytoscape

ようこそCytoscapeのオープンなチュートリアルへ

このポータルの目的はCytoscapeとCytoscapeプラグインのチュートリアルを公開することです。
Cytoscapeはオープンソースのバイオインフォマティクスソフトウエアプラットフォームであり、分子間相互作用ネットワークの可視化と相互作用に関する遺伝子発現プロファイルや他の実験データによる情報の高付加価値化を行うものです。プラグインはネットワーク、分子プロファイル解析、新規のレイアウト、追加のファイルフォーマットの対応、スクリプト化やデータベース接続を行うためのものです。

利用可能なチュートリアル

基本

フィルタと編集 日本語訳完了
Basic Expression Analysis - Yeast
Cytoscapeでの基本的な発現解析−ヒト 日本語訳完了(一部動作がCytoscapeで未確認)

応用

Cytoscape Developers Tutorial

プラグイン

Cytoscapeプラグイン一覧 日本語訳途中
Agilent Literature Search
MiMiPpi Discovery
Structure Visualization and Structure Function Linkage Database
Google Charts Plugin - Creating Pie Charts on Nodes

Analysis plugins

Cluster Maker 日本語訳途中 (プラグインが動作不可のため保留)
Cluster Maker BMC Bioinformatics Scenario 1
Cluster Maker BMC Bioinformatics Scenario 2
Cluster Maker BMC Bioinformatics Scenario 3
DomainGraph
MCODE Plugin Demo
Network Analyzer

Layout plugins

Community Structure Layout
Cytoscape Cerebral Plugin
Power Graph Analysis with CyOog


下記は旧版のチュートリアルの日本語訳です。チュートリアルが更新されましたので今後は上記を参照ください。

このページへのコメント

3XYCrw Thanks a lot for the article post.Thanks Again. Fantastic.

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Posted by check this out 2013年12月21日(土) 03:55:11 返信

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Posted by lmufqqdvk 2013年11月15日(金) 06:51:15 返信

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