22世紀、外宇宙探査のために建造された高速探査艦がイー・アイ・イーです。
　文部科学省と連合艦隊の共同プロジェクトで、オールトの雲より彼方での天体のサンプル採取を目的としています。
　しかし外宇宙で待っていたのは、人類最大の敵だったのです。