画像解析ソフトの定番 ImageJ のまとめ
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はじめまして、記事の方拝見いたしました。現在わたしの研究にてμＣＴの画像を３Ｄ化し、特定の部分だけの体積を測定したいと考えているのですが、操作法が分からず、苦戦しております。管理人様、もし体積測定の手法をご存知であればオンラインにてご教示いただきたくことは可能でしょうか。謝金も用意しています。どうかお助けいただけますと幸いです。よろしくお願い申し上げます。
たけ様、体積を計測する方法とのことですが、ImageJには一発で体積を計算するコマンドは用意されていないと理解しています。代わりにスタック内の各スライスで面積を計測してそれを積分するような計算を、手動またはマクロ等を使って行うことになるのかなと思います。これが面倒な場合は、体積を計算するプラグインが各種公開されています。「ImageJ 体積」などで検索して、たけ様の用途に使えそうなのを試してみるとよいのではないでしょうか。画像をスタックにして、閾値設定すれば、あとは自動的に体積を計算してくれると思います。
aaaa 様、ご丁寧にお知らせをいただきましてありがとうございました。管理人です。遅くなりましたが反映させました。もうずっとコンテンツ拡充をサボっていますが、あると役に立ちそうな文書をみつけて、また追加してみたいと思っています。
「ImageJではじめる生物画像解析」のKindle版は利用できなくなってます。
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はじめまして、記事の方拝見いたしました。
現在わたしの研究にてμＣＴの画像を３Ｄ化し、特定の部分だけの体積を測定したいと考えているのですが、操作法が分からず、苦戦しております。
管理人様、もし体積測定の手法をご存知であればオンラインにてご教示いただきたくことは可能でしょうか。謝金も用意しています。どうかお助けいただけますと幸いです。よろしくお願い申し上げます。
たけ様、体積を計測する方法とのことですが、ImageJには一発で体積を計算するコマンドは用意されていないと理解しています。代わりにスタック内の各スライスで面積を計測してそれを積分するような計算を、手動またはマクロ等を使って行うことになるのかなと思います。これが面倒な場合は、体積を計算するプラグインが各種公開されています。「ImageJ 体積」などで検索して、たけ様の用途に使えそうなのを試してみるとよいのではないでしょうか。画像をスタックにして、閾値設定すれば、あとは自動的に体積を計算してくれると思います。
aaaa 様、ご丁寧にお知らせをいただきましてありがとうございました。管理人です。遅くなりましたが反映させました。もうずっとコンテンツ拡充をサボっていますが、あると役に立ちそうな文書をみつけて、また追加してみたいと思っています。
「ImageJではじめる生物画像解析」のKindle版は利用できなくなってます。