| | JR東京駅 | 地上ホーム |
| 1 | | 中央線 | お茶の水・新宿・立川方面 |
| 2 | | 中央線 | お茶の水・新宿・立川方面 |
| 3 | | 京浜東北線北行 | 上野・大宮方面 |
| 4 | | 山手線内回り | 上野・池袋方面 |
| 5 | | 山手線外回り | 品川・渋谷方面 |
| 6 | | 京浜東北線南行 | 鎌田・関内方面 |
| 7 | | 上野東京ライン | 上野・大宮・高崎・宇都宮・水戸方面 |
| 8 | | 上野東京ライン | 上野・大宮・高崎・宇都宮・水戸方面 |
| 9 | | 東海道線 | 品川・横浜・小田原・熱海・伊東方面 |
| 10 | | 東海道線 | 品川・横浜・小田原・熱海・伊東方面 |
| | JR東京駅 | 総武地下ホーム |
| 1 | | 横須賀線 | 横浜・鎌倉方面 |
| 2 | | 横須賀線 | 横浜・鎌倉方面 |
| 3 | | 総武快速線 | 千葉・市川方面 |
| 4 | | 総武快速線 | 千葉・市川方面 |
| | JR東京駅 | 京葉地下ホーム |
| 1・2・3・4 | | 京葉線 | 舞浜・海浜幕張・蘇我方面 |
| 1・2・3・4 | | 武蔵野線 | 舞浜・西船橋方面 |
| | JR東京駅 | 新幹線ホーム |
| 14 | | 東海道新幹線 | 名古屋・新大阪方面 |
| 15 | | 東海道新幹線 | 名古屋・新大阪方面 |
| 16 | | 東海道新幹線 | 名古屋・新大阪方面 |
| 17 | | 東海道新幹線 | 名古屋・新大阪方面 |
| 18 | | 東海道新幹線 | 名古屋・新大阪方面 |
| 19 | | 東海道新幹線 | 名古屋・新大阪方面 |
| 20 | | 東北・山形・秋田・北海道・上越・北陸新幹線 | 宇都宮・仙台・新青森・新函館北斗・新庄・秋田・高崎・新潟・長野・金沢方面 |
| 21 | | 東北・山形・秋田・北海道・上越・北陸新幹線 | 宇都宮・仙台・新青森・新函館北斗・新庄・秋田・高崎・新潟・長野・金沢方面 |
| 22 | | 東北・山形・秋田・北海道・上越・北陸新幹線 | 宇都宮・仙台・新青森・新函館北斗・新庄・秋田・高崎・新潟・長野・金沢方面 |
| 23 | | 東北・山形・秋田・北海道・上越・北陸新幹線 | 宇都宮・仙台・新青森・新函館北斗・新庄・秋田・高崎・新潟・長野・金沢方面 |
| 東京メトロ東京駅 | ホーム |
| 1 | 丸の内線 | 荻窪方面 |
| 2 | 丸の内線 | 池袋方面 |
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