SharePoint Onlineで作ったサイトを削除するには、まず、そこのサイトへ行き、
「歯車マーク」をクリックし、「サイトの設定」を選択します。



そして、「サイトの操作」の中の「このサイトを削除」をクリックします。



以下の画面で「削除」をクリック後、表示されたメッセージで「OK」をクリックしたら、削除されます。



ただ、削除後もユーザーグループ名が残っているようです。
再度、同じ名前でサイトを作成したら、ユーザーグループ名の後ろに数字が付いて作成されました。