機体は開発した状態では低い性能（現行Ｃ相当、必殺技燃費も悪い）であるが、チューンアップを行うことによりMSの能力自体を強化できる。
例：「必殺+100」「ビーム防御+100」等。

チューンアップはその機体を使って（もしくはセットして）行い、ミッション・マッチングそれぞれの条件に応じてボーナスという形で付与される（ＴＫ１弾〜）。
条件その他についてはビルドＭＳシステム参照。


上昇する能力は選択できず、機体ごとに４パターンの中から選ばれ能力が向上する。
見分ける手段は、最初のチューンアップで向上する能力。
ＨＰ・アタック・スピード・必殺の４パターンから選ばれている。
これらについては「ＨＰ開始型」「アタック開始型」等と暫定呼称し、各機体ページでは「ＨＰスタート」「アタックスタート」などと記載される。

２０回チューン時の総合上昇能力（Ｂ１弾）
※ここまでは1回毎に+100か+200されるのでステータスの伸びが良く、開発条件にも絡む機体もあるので、たまに使用する程度の機体、ビルドアクションだけが目的の機体でもこの辺りまではチューンを重ねておくと良い。
　加えてＢ５弾からのアビリティスイッチも１０回チューンで１回目が開放される。

３０回チューン時の総合上昇能力（Ｂ２弾）
※21回目以降は1回毎のステータス上昇量が半分に低下。
　使用頻度の高い機体でもない限り無視して上げる必要は無いであろう。
　しかし、Ｂ５弾からのアビリティスイッチの２回目がここで開放。
　40回目まで大きな変化が無かった今までよりモチベーションアップとなったのはありがたいところである。
　以降はアビリティこそタイプ毎に固定であるものの、アタッカー・ディフェンダー・ガンナーの切替が自在に可能になり、用途に応じて戦術変更が容易となる。

４０回チューン時の総合上昇能力（Ｂ３弾）
※ステータスの伸びは相変わらずだが、40回チューンでアクションコスト上限+1という劇的な進化を果たす。
　ビルドアクションの選ぶ幅が大きく広がるのでメインで使用する機体ならばぜひとも上げておきたいところ。

４５回チューン時の総合上昇能力（Ｂ４弾）

５０回チューン時の総合上昇能力（Ｂ５弾）
※コストバトルではここで固定の為、常に展開状態にしています。

	ＨＰ	アタック	スピード	ダゲキ防御	ビーム防御	ジツダン防御	必殺	その他
ＨＰ開始型	+850	+400	+400	+600	+700	+550	+600	アクションコスト 上限+1
アタック開始型	+350	+1000	+650	+400	+300	+400	+1000
スピード開始型	+350	+600	+1050	+350	+500	+600	+650
必殺開始型	+550	+550	+550	+500	+550	+600	+800

※成長タイプによるステータス上昇の差は前回と殆ど変わらずにそのまま伸び続けている。
　Ｂ５弾から新たなバトルタイプとアビリティが選択可能なアビリティスイッチが登場した。
　（無論、Ｂ４弾までに３０回以上チューンされたビルドＭＳは最初から３種類の切替が可能となっている。）

５５回チューン時の総合上昇能力（Ｂ６弾）
※ＳＰではここが限界値である為、常に展開状態にしています。

	ＨＰ	アタック	スピード	ダゲキ防御	ビーム防御	ジツダン防御	必殺	その他
ＨＰ開始型	+900	+400	+400	+650	+750	+600	+700	アクションコスト 上限+1
アタック開始型	+400	+1100	+700	+400	+400	+400	+1000
スピード開始型	+400	+700	+1100	+400	+500	+600	+700
必殺開始型	+600	+600	+600	+600	+600	+600	+800

※丁度、必殺開始型が必殺以外がALL+600に並びその他もほぼキリの良い上昇値に統一された。
　ＨＰ開始型とスピード開始型は一部ステータスの伸びが悪いものがあるとは言え、それぞれの長所となるＨＰやスピード以外は必殺開始型とそこまで大きな差は無くなった。
　対してアタック型はアタックと必殺がダントツに高い分、ＨＰと各種防御をかなり削っている。
ちなみに耐性に大きくチューン数値を持っていかれるＨＰスタート以外はここまでのチューンをすることで、なんと各々の排出Ｐレアすら抜いた能力にする事が可能。
　以下５５回以上のチューンでは基礎ステが９０００以上になる機体も続出する。

６５回チューン時の総合上昇能力（Ｂ７弾）

７０回チューン時の総合上昇能力（ＢＧ１弾）

７５回チューン時の総合上昇能力（ＢＧ２弾）

８０回チューン時の総合上昇能力（ＢＧ３弾）

８５回チューン時の総合上昇能力（ＢＧ４弾）

９０回チューン時の総合上昇能力（ＢＧ５弾）

９５回チューン時の総合上昇能力（ＢＧ６弾）

１００回チューン時の総合上昇能力（鉄血１弾）

	ＨＰ	アタック	スピード	ダゲキ防御	ビーム防御	ジツダン防御	必殺	その他
ＨＰ開始型	+1200	+500	+500	+850	+850	+850	+850	アクションコスト 上限+2
アタック開始型	+500	+1400	+850	+500	+500	+500	+1350
スピード開始型	+450	+850	+1450	+600	+600	+750	+900
必殺開始型	+800	+750	+750	+750	+750	+750	+1050

※開発機数制限によるグレード上限が撤廃された為、システム解放でいきなりここまで上げれるようになった。
　大半の機体はＰやＳＥＣクラスの戦力となってくれるだろう。
　ただ、フレームシステムの実装と１プレイ＝１チューンの方式が廃止され、ハンティングシステムでチューンアップパーツを取るか、ネットワークマッチングモードで勝利するか、はたまたブーストチャージ（フルチャージ）を行う、一部のミッションで特別任務を達成する等のチューンアップをする方法が限られてしまったため、ここまでたどり着くには相当のこだわりと愛が必要となった。
　が、同時に開発系統毎に必要なチューンは１つに統合されたので総合的な敷居自体は低くなった。

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チューニング傾向として、２０回チューン時の能力上昇値３００を基準としてそれを上回る能力から考えると、
「ＨＰ開始型」･･･各防御力とＨＰが大きく強化される「耐久力チューン」
(イメージはビグ・ザム)
「アタック開始型」･･･防御は切り捨て、アタックと必殺の威力強化を徹底追及、スピードも重視した「高火力チューン」
(イメージはＡＧＥ−１タイタス)
「スピード開始型」･･･スピードの強化が顕著だがアタックとジツダン防御も頭一つ飛びぬけた「高機動･強襲チューン」
(イメージはＡＧＥ−１スパロー)
「必殺開始型」･･･必殺の威力を高めつつ、他の全能力がバランス良く強化される「汎用チューン」
(イメージはＡＧＥ−１ノーマル、ガンダム)
と言えるか。

また、５の倍数＝グレードの向上時は、そのチューンアップで向上する能力が+200される（20回目まで）。
２１回目以降（Ｂ２弾で解放された部分）については、各能力が+50づつ上昇、グレード向上時は+100。
Ｂ２弾では３０回までのチューン…グレード７までが解放された。
Ｂ３弾では４０回までのチューン…グレード９までが解放され、フルチューンで初のアクションコスト上限+1が発生(コスト6も7まで上限+1される)。
Ｂ７弾現在では６０回までチューンができるようになり、再びアクションコスト上限が+1される。
ＴＫ１弾でグレード概念は消滅したものの全体の上昇傾向に変化はない。

これらを踏まえた各型ごとの向上能力は次の通り。
「ビルドＭＳ選抜戦」（Ｂ８弾）等初期配備状態からチューンが行われる場合、こちらから類推する形となる。

チューン回数	ＨＰ型	アタック型	スピード型	必殺型	上昇量
1	ＨＰ	アタック	スピード	必殺	+100
2	ビーム防御	ダゲキ防御	アタック	ＨＰ	+100
3	スピード	スピード	ジツダン防御	ダゲキ防御	+100
4	必殺	アタック	ビーム防御	スピード	+100
5	ダゲキ防御	必殺	スピード	アタック	+200
6	ビーム防御	ＨＰ	必殺	ジツダン防御	+100
7	必殺	ビーム防御	ダゲキ防御	ＨＰ	+100
8	ジツダン防御	必殺	アタック	スピード	+100
9	アタック	スピード	ＨＰ	必殺	+100
10	ＨＰ	アタック	必殺	ビーム防御	+200
	アビリティスイッチ可能（１回目）
11	ビーム防御	ジツダン防御	スピード	アタック	+100
12	スピード	必殺	ジツダン防御	ダゲキ防御	+100
13	ダゲキ防御	ダゲキ防御	スピード	ジツダン防御	+100
14	ジツダン防御	スピード	ダゲキ防御	スピード	+100
15	ビーム防御	必殺	アタック	必殺	+200
16	ＨＰ	ジツダン防御	必殺	ビーム防御	+100
17	必殺	スピード	スピード	ダゲキ防御	+100
18	ダゲキ防御	ＨＰ	ＨＰ	必殺	+100
19	アタック	ビーム防御	ビーム防御	ジツダン防御	+100
20	ジツダン防御	アタック	ジツダン防御	ＨＰ	+200
21	スピード	ダゲキ防御	スピード	アタック	+50
22	ＨＰ	必殺	必殺	ジツダン防御	+50
23	ダゲキ防御	アタック	ビーム防御	スピード	+50
24	必殺	スピード	ジツダン防御	ビーム防御	+50
25	ビーム防御	必殺	スピード	必殺	+100
26	ダゲキ防御	アタック	ジツダン防御	ジツダン防御	+50
27	ＨＰ	スピード	必殺	スピード	+50
28	スピード	必殺	スピード	アタック	+50
29	必殺	ダゲキ防御	ビーム防御	ビーム防御	+50
30	ＨＰ	アタック	アタック	ダゲキ防御	+100
	アビリティスイッチ可能（２回目）
31	アタック	ジツダン防御	スピード	ＨＰ	+50
32	ダゲキ防御	ＨＰ	ＨＰ	ジツダン防御	+50
33	必殺	スピード	必殺	スピード	+50
34	ＨＰ	アタック	ジツダン防御	アタック	+50
35	ビーム防御	ジツダン防御	スピード	ビーム防御	+100
36	ジツダン防御	必殺	ＨＰ	ダゲキ防御	+50
37	ＨＰ	アタック	ビーム防御	スピード	+50
38	スピード	ビーム防御	アタック	必殺	+50
39	必殺	スピード	必殺	ＨＰ	+50
40	アクションコスト上限+1（１回目）
41	必殺	ＨＰ	スピード	アタック	+50
42	ジツダン防御	ジツダン防御	ジツダン防御	ジツダン防御	+50
43	ダゲキ防御	必殺	ビーム防御	必殺	+50
44	必殺	ダゲキ防御	アタック	ダゲキ防御	+50
45	ＨＰ	アタック	ダゲキ防御	ジツダン防御	+100
46	アタック	ビーム防御	スピード	ＨＰ	+50
47	ジツダン防御	ＨＰ	ＨＰ	ビーム防御	+50
48	ＨＰ	スピード	ダゲキ防御	スピード	+50
49	スピード	ダゲキ防御	必殺	アタック	+50
50	アタック	必殺	ビーム防御	必殺	+100
51	ＨＰ	アタック	ダゲキ防御	ビーム防御	+50
52	ビーム防御	スピード	必殺	アタック	+50
53	ダゲキ防御	ＨＰ	スピード	スピード	+50
54	ジツダン防御	アタック	ＨＰ	ＨＰ	+50
55	必殺	ビーム防御	アタック	ダゲキ防御	+100
56	ＨＰ	スピード	ジツダン防御	必殺	+50
57	アタック	アタック	スピード	スピード	+50
58	ジツダン防御	必殺	ダゲキ防御	アタック	+50
59	ダゲキ防御	ダゲキ防御	アタック	ＨＰ	+50
60	アクションコスト上限+1（２回目）
61	スピード	アタック	ダゲキ防御	ジツダン防御	+50
62	ＨＰ	必殺	アタック	必殺	+50
63	ダゲキ防御	ビーム防御	スピード	ビーム防御	+50
64	必殺	スピード	ジツダン防御	ＨＰ	+50
65	ジツダン防御	ＨＰ	必殺	ダゲキ防御	+100
66	ＨＰ	必殺	スピード	ジツダン防御	+50
67	ビーム防御	ジツダン防御	必殺	アタック	+50
68	ダゲキ防御	アタック	ＨＰ	ビーム防御	+50
69	ジツダン防御	スピード	ダゲキ防御	スピード	+50
70	必殺	必殺	ビーム防御	ＨＰ	+50
71	ジツダン防御	必殺	スピード	ダゲキ防御	+30
72	ビーム防御	アタック	アタック	スピード	+30
73	スピード	ダゲキ防御	必殺	ビーム防御	+30
74	アタック	ビーム防御	ジツダン防御	アタック	+30
75	ＨＰ	必殺	ダゲキ防御	必殺	+30
76	ＨＰ	アタック	スピード	必殺	+20
77	スピード	ジツダン防御	ビーム防御	ジツダン防御	+20
78	アタック	必殺	アタック	ビーム防御	+20
79	ダゲキ防御	ダゲキ防御	ビーム防御	ダゲキ防御	+20
80	必殺	アタック	スピード	必殺	+20
81	必殺	ビーム防御	スピード	必殺	+10
82	ダゲキ防御	必殺	ダゲキ防御	アタック	+10
83	ジツダン防御	アタック	必殺	ジツダン防御	+10
84	ビーム防御	ビーム防御	ジツダン防御	スピード	+10
85	必殺	ジツダン防御	スピード	必殺	+10
86	ＨＰ	必殺	スピード	ＨＰ	+10
87	必殺	ジツダン防御	ジツダン防御	スピード	+10
88	ＨＰ	必殺	スピード	ＨＰ	+10
89	ビーム防御	アタック	ダゲキ防御	必殺	+10
90	ＨＰ	必殺	スピード	ＨＰ	+10
91	ダゲキ防御	必殺	スピード	ジツダン防御	+10
92	ＨＰ	アタック	ビーム防御	ＨＰ	+10
93	ジツダン防御	必殺	スピード	アタック	+10
94	ダゲキ防御	ジツダン防御	必殺	ジツダン防御	+10
95	ＨＰ	必殺	スピード	ＨＰ	+10
96	ＨＰ	アタック	スピード	必殺	+10
97	ＨＰ	アタック	スピード	必殺	+10
98	ＨＰ	アタック	スピード	必殺	+10
99	ＨＰ	アタック	スピード	必殺	+10
100	ＨＰ	アタック	スピード	必殺	+10