Wiki内検索
Menu
最近更新したページ
2007-09-11
2007-01-18
2006-12-21
2006-12-20
2006-11-08
2006-11-07
2006-10-31
2006-10-30
最新コメント
FrontPage by stunning seo guys
MATLAB by awesome things!
実験小話 by stunning seo guys
ゲノムの不安定性 by check it out
Bookmarks by stunning seo guys
実験小話 by watch for this
細胞周期 by check this out
ゲノムの不安定性 by tips about seo
FrontPage by tips about seo
Bookmarks by watch for this
タグ

MATLAB

基本事項

  • 貼り付け
   strpaste
  • helpを参照する
   help プログラム名


遺伝子配列をなおす

  • 遺伝子配列を大文字にする
   upper(名前)
  • 遺伝子配列を小文字にする
   lower(名前)
  • 遺伝子配列を相補鎖にする
   antisense(名前)
  • 遺伝子配列をantiparallele(reverse antisense)にする
   antipara(名前)


遺伝子関係

  • 遺伝子配列を得る
   getgenbank('NM番号','SequenceOnly',true)

  • 塩基の情報(ATGCの数を確認)
   basecount(名前) ・・・・・atgcの数
   dimercount(名前) ・・・・・2塩基(例えばAT)の数

   グラフにしたいときは(名前,'chart','pie')(名前,'chart','bar')とすればよい

  • 塩基の分布状況を確認
   ntdensity(名前)

  • Open Reading Frameの検索
   seqshoworfs(名前)

  • Tm値を調べる
   dnahelix(名前)

  • 制限酵素でカット
   digest(配列の名前,'酵素の名前')
   サークルの場合はdigest(配列の名前,'酵素の名前',1)とする

  • 制限酵素を探す
   findallsites(名前)
2006年12月20日(水) 13:06:05 Modified by ficedula_mugimaki




スマートフォン版で見る