画像解析ソフトの定番 ImageJ のまとめ

ImageJ 旧公式サイト(imagej.nih.gov、米国国立衛生研究所 NIH)で公開されてきたImageJマニュアルを中心とした内容の日本語訳です。

ご注意
  • これからImageJを使用する方は、https://imagej.net/から ImageJ2 または Fiji をダウンロードしてご利用ください。ImageJ2 や Fiji の基本機能は ImageJ のままなので、このサイトの情報を利用できます。
  • ImageJ の最新バージョン(2025年1月現在)は 1.54です。このサイトの日本語訳が利用している説明文は2022〜2023年に最終更新された内容ですので、一部の内容が最新版とは異なっているかもしれません。

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このページへのコメント

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Posted by あ 2018年07月12日(木) 14:47:09 返信

ImageJで2GB以上の画像を取り扱おうとすると、
Image is too large. ImageJ does not support single images larger than 2 gigapixels.
というアラートが出ます。これはImageJ や Fijiでは画像を32ビット整数型として扱っているための制限です。PC、OS、Javaのすべてが64ビット対応し、ImageJのメモリ割当をどんなに増やしても、同時に開ける画像の合計容量が増加するだけで、1枚の画像の上限には「2GBの壁」があります。この問題のことですよね。
次バージョンのImageJ2ではImgLib というライブラリを使うことで、この制限をなくすとのことですが、現在ImageJ2はまだ開発中で、一部機能が未実装です。ご自分でプログラムをいじることをお考えなら、ImageJ2の開発サイトや、ImgLibについて調べてみていただくとヒントになるかもしれません。

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Posted by 自分もあまり詳しくない 2015年08月04日(火) 11:26:31 返信

ImageJでtiff画像を読み込むことの出来る容量を引き上げたいと考えています。現在、ImageJ64bitを使用し、Memory&Threadsを3010MBまで拡大したところ、1.3GB前後のtiff画像を読み込むことが出来ました。2GB前後を読み込むために、ソースコードを改良したいと考えています。方法が分かる方、どなたかご教示いただければと思います。よろしくお願いいたします。

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Posted by Tanaka 2015年08月03日(月) 22:45:25 返信

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